Tuy có nhiều ưu điểm, Running Sushi cũng gặp phải không ít thách thức. Đầu tiên là vấn đề vệ sinh và bảo quản thực phẩm. Vì các món ăn được trưng bày liên tục trên băng chuyền, thời gian lưu lại quá lâu có thể ảnh hưởng đến chất lượng món ăn.V.