Sau các sự kiện tàn khốc của phần một, thế giới tưởng rằng Kraken đã bị tiêu diệt. Tuy nhiên, một tổ chức công nghệ ngầm tên là AETHRA đã thu thập được ADN của Kraken và tái sinh nó trong một phòng thí nghiệm dưới đáy biển sâu. Không dừng lại ở